流式細胞儀的光學系統(tǒng)由若干組光學透鏡、小孔、濾光片組成，大致可分為流動室前和流動室后兩組。流動室前的光學系統(tǒng)由透鏡和小孔組成，透鏡和小孔（一般為2片透鏡、1個小孔）的主要作用是將激光光源發(fā)出的橫截面為圓形的激光光束聚焦成橫截面較小的橢圓形激光光束，使激光能量成正態(tài)分布，使通過激光檢測區(qū)的細胞受照強度一致，大限度的減少雜散光的干擾；流動室后的光學系統(tǒng)主要由多組濾光片組成，濾光片的主要作用是將不同波長的熒光信號送到不同的光電倍增管。
高透過深截止系列濾光片五組系列代表：
1、Ex470/30-Em515/30 濾光片系列，
適用試劑FAM
2、Ex530/20-Em560/20 濾光片系列，
適用試劑HEX
3、Ex580/30-Em620/30 濾光片系列，
適用試劑ROX
4、Ex630/20-Em660/20 濾光片系列，
適用試劑CY5
5、Ex690/20-Em730/20 濾光片系列，
適用試劑CY5.5
流式細胞儀通道濾光片適用：
通道 | 熒光物質(zhì) | 激發(fā)波長（nm) | 發(fā)射波長（nm) |
綠色 | FAM | 494 | 518 |
FITC(Fluorescein) | 489 | 517 | |
Alexa Fluor 488 | 496 | 519 | |
黃色 | JOE | 520 | 548 |
VIC | 538 | 554 | |
HEX | 535 | 556 | |
TET | 521 | 536 | |
CAL Flour Orange 560 | 538 | 559 | |
橙/紅 | ROX | 575 | 602 |
Cy 3.5 | 578 | 591 | |
Alexa Flour 568 | 578 | 603 | |
深紅 | Cy5 | 649 | 666 |
Quasar 670 | 647 | 670 | |
Alexa Flour 633 | 632 | 764 |
流式細胞儀濾光片在儀器中的功能和應用：
細胞周期的分析
干細胞研究
癥病人的多藥耐藥性
細胞動力學功能研究
環(huán)境微生物分析
流式細胞術與分子生物學研究
流式細胞術在兔疫檢驗中的應用
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